ROSA Linux

во-во, лучше стараться им не пользоваться вообще или снизить количество программ оттуда до минимума

Флатпак еще и свои оси целиком тянет... Ту же убунту, плюс, если там гном или плазма то их полностью... Тогда, да вполне возможно что 30 гигов бвстро закончатся.... Ну и /var/log проверить, иногда бывают случаи когда дампы ядра сходят с ума и забивпют все место собой

Надо тоже с умом там зачищать...

Да. Типа: dnf update plasma* dnf update kernel* dnf update

В смысле обновлять частями? Обновить одну конкретную софтину, которая потянет за собой свои зависимости и так далее? Начав с ядра, например?

Если обновлять очень редко такое может быть. Днф пытается обновить все в одну транзакцию, а общий объем накопленных обновлений примерно равен установленной ОС. В таком случае можно пробовать обновлять частями.

Ну можете попробовать flatpak uninstall --unused Только посмотрите, что он предложит к удалению. Насколько помню, он бывает хранит старые уже не нужные рантаймы. Если же у вас десяток разных рантаймов под десяток разных приложений, то не поможет. Одна из причин, кстати, почему Флатпак так себе идея на постоянной основе, проще жить с Аппимадж.

flatpak занимает много.

Вот:

Обычно там программы хранят временные файлы, если что.